Para una mejor atención a los fieles y desmembrándola de la parroquia de la Catedral, Monseñor Rubén Buitrago Trujillo, por decreto Nº 40 de 1984 creó la parroquia que fue inaugurada en 1º de enero de 1985 y nombró como primer párroco al Padre Pío Gabriel Solano Villamil. La Capilla funcionó durante muchos años como capellanía que dependía de la Catedral. Monseñor Joselín Castillo, párroco de la Catedral construyó el actual templo sobre escombros del antiguo y remodeló la actual casa cural (1920-1930). En el templo estuvieron los restos de los mártires zipaquireños que ahora se encuentran en la Catedral. El cementerio se trasladó al barrio San Juanito. En la casa cural estuvieron las Hermanas del Famulato Cristiano atendiendo pastoralmente a los fieles, quienes hicieron un trabajo loable con esta comunidad parroquial.